Budoucnost šlechtění začíná v DNA.
Co je genomika?
Genomické hodnocení představuje moderní metodu odhadu genetické hodnoty koní založenou na analýze DNA. Na rozdíl od klasického genetického hodnocení, které využívá především rodokmen, výkonnost a informace o příbuzných, genomika umožňuje využít informace přímo z genetické výbavy každého jedince.
Genomické informace mohou zpřesnit odhad genetického potenciálu zejména u mladých koní, kteří ještě nemají vlastní sportovní výsledky ani potomstvo. Přesnost tohoto odhadu však závisí především na velikosti a kvalitě referenční populace.
Každý kůň nese ve své DNA miliony genetických informací, které ovlivňují jeho výkonnost, zdraví, exteriér i další vlastnosti. Genomické hodnocení využívá tisíce genetických markerů označovaných jako SNP (Single Nucleotide Polymorphisms) rozmístěných po celém genomu koně.
DNA si můžeme představit jako velmi dlouhý text složený z genetických „písmen“. SNP marker je místo, kde se dva koně mohou lišit například v jediném písmenu genetické informace.
Jeden SNP marker obvykle sám o sobě nerozhoduje o výkonnosti ani jiných vlastnostech. Pokud však analyzujeme desetitisíce těchto drobných rozdílů současně, získáme genetický profil koně, který může pomoci zpřesnit odhad jeho genetického potenciálu.
Jak probíhá genomické hodnocení?
Odběr vzorku – žíně s kořínky.
Genotypizace – stanovení desítek tisíc SNP markerů.
Výpočet genomické plemenné hodnoty.
Porovnání s referenční populací.
Analýzou těchto markerů lze odhadnout, jaké genetické varianty kůň zdědil a jaký vliv mohou mít na sledované vlastnosti.
Co je referenční populace?
Referenční populace je skupina koní, u kterých známe jak genetický profil získaný z DNA, tak také jejich výkonnost, původ, exteriér nebo další sledované vlastnosti.
Právě na základě těchto koní se vytvářejí statistické modely, které propojují genetické informace s konkrétními vlastnostmi.
Když je následně genotypován mladý kůň bez vlastní sportovní výkonnosti nebo potomstva, lze jeho genetický profil porovnat s referenční populací a odhadnout jeho genetický potenciál.
Čím větší a kvalitnější referenční populace je, tím přesnější může být genomické hodnocení.
Klasická vs. genomická plemenná hodnota
Klasické hodnocení využívá rodokmen, výkonnost a potomstvo.
Genomické hodnocení tyto informace doplňuje o údaje získané přímo z DNA koně. Genomické informace mohou zpřesnit odhad genetického potenciálu zejména u mladých koní, avšak přesnost závisí na velikosti a kvalitě referenční populace.
Místo informace o průměru předků využívá informace o skutečně zděděných genetických variantách.
Proč je genomika důležitá?
Sourozenci nejsou geneticky totožní. Přestože mají stejné rodiče, každý potomek zdědí jinou kombinaci genů.
Genomika umožňuje zjistit, jakou genetickou kombinaci skutečně zdědil konkrétní jedinec a zpřesnit tak odhad jeho genetického potenciálu.
Výhody genomického hodnocení
možnost zpřesnění odhadu genetického potenciálu u mladých koní,
rychlejší genetický pokrok,
lepší rozhodování chovatelů,
objektivnější výběr plemeníků a klisen.
Co genomika neumí?
Genomické hodnocení není "křišťálová koule". Nedokáže s jistotou určit budoucí sportovní kariéru, charakter koně ani vliv výcviku a prostředí.
DNA představuje pouze genetický základ. Konečný výsledek je vždy ovlivněn také prostředím, výživou, managementem, zdravotním stavem a kvalitou výcviku.
Genomika ve světovém chovu sportovních koní
Genomické hodnocení je využíváno řadou významných chovatelských organizací a výzkumných pracovišť.
Význam genomiky roste s rozšiřováním referenčních populací a zvyšováním přesnosti odhadů.
Genomika a Český sportovní kůň
V populaci Českého sportovního koně je cílem postupně vytvářet podmínky pro využití genomických metod, zejména budováním referenční populace a propojením genotypových, rodokmenových a výkonnostních údajů.
V budoucnu mohou genomické informace doplnit tradiční plemenné hodnoty a přispět k přesnějšímu genetickému hodnocení sportovních koní.
Jaký přínos může mít genotypování pro chovatele?
Vedle využití při výpočtu genomických plemenných hodnot přináší genotypování i řadu dalších praktických výhod.
Ověření původu
Genotyp získaný pomocí SNP markerů lze využít k ověření původu hříbat.
V budoucnu to může přinést:omezení duplicitních laboratorních analýz,
vyšší spolehlivost kontroly původu,
využití jednoho genetického vyšetření pro více účelů.
Přesnější genetické hodnocení
Genotypování umožňuje získat informace o genetické výbavě koně již v mladém věku.Budování referenční populace
Každý nově genotypovaný kůň rozšiřuje databázi využívanou pro genomické hodnocení.Podpora moderního šlechtění
Genomická data představují důležitý zdroj informací pro budoucí rozvoj šlechtitelského programu.
Podpora genotypování v PK CS
Rozvoj genomických metod představuje významný krok směrem k přesnějšímu genetickému hodnocení sportovních koní.
Budování referenční populace a postupné rozšiřování genomických dat může v budoucnu přispět ke zvýšení přesnosti genetického hodnocení a podpořit moderní, datově založené šlechtění v populaci Českého sportovního koně.
Nejčastější otázky
Znamená genomická plemenná hodnota, že bude kůň úspěšný ve sportu?
Ne.
Mohou mít sourozenci rozdílné genomické hodnocení?
Ano.
Nahrazuje genomika klasické plemenné hodnoty?
Ne.
Je genomika budoucností šlechtění sportovních koní?
Ano, ale její přínos závisí především na velikosti a kvalitě referenční populace.
Slovníček pojmů
DNA – genetická informace koně uložená v každé buňce organismu.
Genom – kompletní soubor genetické informace koně.
SNP marker – drobná odlišnost v DNA. DNA si lze představit jako dlouhý text složený z písmen a SNP je místo, kde se jednotliví koně mohou lišit v jednom „písmenu“ genetické informace.
Genotypizace – laboratorní vyšetření DNA, při kterém se zjišťují genetické varianty na tisících míst genomu.
Genotyp (genetický profil) – soubor genetických variant zjištěných u konkrétního koně.
Referenční populace – skupina koní s DNA údaji a známou výkonností, původem nebo dalšími sledovanými vlastnostmi. Slouží jako základ pro genomické hodnocení.
Genomická plemenná hodnota – odhad genetického potenciálu využívající kromě tradičních údajů také informace z DNA.
